Musiikkiopiston hallinnosta vastaa Saarijärven kaupungin sivistyslautakunnan alainen musiikkiopiston johtokunta, johtokunnan kokouksissa esittelijänä ja sihteerinä toimii musiikkiopiston rehtori. Johtokunta kokoontuu tarpeen vaatiessa, yleensä neljä kertaa vuodessa.
Musiikkiopiston johtokunta 2017 – 2021
Jäsenet
Saarijärvi
Pirjo Leppämäki (puheenjohtaja), Arja Viitaniemi ja Petri Tavinen
Kannonkoski
Tarja Sonninen
Karstula
Petri Piispanen, Violetta Chornobil
Kivijärvi
Martti Hertteli
Kyyjärvi
Anna-Maria Koskelo
Varajäsenet kunnittain
Saarijärvi: Mikko Kallio, Kaisa Ilola, Raimo Suuronen
Kannonkoski: Irene Poikonen
Karstula: Riikka Oikari, Eemil Lahdenvesi
Kivijärvi: Heikki Näsi
Kyyjärvi: Tuula Noponen